Untuk menumpas pemberontakan Permesta diadakan operasi yang disebut

operasi gabungan yg dinamakan Operasi Merdeka yg dipimpin olh Letkol Rukminto Hendradiningrat

1. Operasi saptamarga 1 (sulawesi utara bagian tengah) dipimpin oleh letnan kolonel Soemarsono.
2. Operasi saptamarga 2 (sulawesi utara bagian selatan) dipimpin oleh letnan kolonel Agus prasmono.
3. Operasi saptamarga 3 (pulau di sekitar manado) dipimpin oleh letnan kolonel Magenda.
4. Operasi saptamarga 3 (sulawesi utara) dipimpin oleh letnan kolonel Rukmito Hendradiningrat.
5. Operasi mena 1 (joilolo) di pimpin oleh letnan kolonel pieters.
6. Operasi mena 2 (lapanhan udara morotai, Almahera) dipimpin oleh Hunholz.